Das methodische Potenzial der neuen Sequenziertech

Authors: AW Kuss

Publish Date: 2014/07/17

Volume: 26, Issue: 2, Pages: 264-272

PDF Link

Abstract

In diesem Beitrag wird eine Reihe wichtiger Anwendungen der neuen Sequenziertechnologien bzw des Next Generation Sequencing NGS vorgestellt An ausgewählten Beispielen werden für jede Methode die Anwendungsmöglichkeiten in der humangenetischen Forschung dargestellt jeweils das prinzipielle Vorgehen beschrieben und mögliche Quellen für ausführliche Arbeitsanweisungen vorgestellt Die beschriebenen Techniken umfassen im Einzelnen RNASequenzierung mittels NGS „RNASeq“ Chromatinimmunpräzipitation in Kombination mit NGS „ChIPSeq“ „ribosome profiling“ Immunpräzipitation methylierter DNASegmente in Kombination mit NGS „methylated DNA immunoprecipitation“ bzw „MeDIPSeq“ und die HiCTechnik eine Weiterentwicklung der ChromosomeConformationCapture3cMethodeIn this article a number of important applications for next generation sequencing NGSbased techniques are presented For each method the technical principles are introduced the application options in human genetic research using selected examples are illustrated and possible sources for detailed protocols are indicated The following methods are described RNA sequencing using NGS RNAseq chromatin immunoprecipitation in combination with NGS ChIPseq ribosome profiling methylated DNA immunoprecipitation in combination with NGS MeDIPseq and the HiC technique an extension of the chromosome confirmation capture 3c method

Keywords: